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首先，冷冻条件下虽然可以延缓肌肉颜色的变化速度，但随着时间的延长，肌红蛋白会逐渐与氧气发生反应，肉的颜色会逐渐变暗。
其次，在冻藏过程中，由于冰晶增大会使肌肉细胞破裂，导致肌肉脱水、变性，肉的干枯现象也逐渐严重，会影响肉的品质，口感会变差，没有新鲜肉的滑嫩口感。
另外，肉类长期冷冻保存也会造成脂肪和蛋白质的缓慢氧化、维生素含量的下降，从而使其营养价值会有少许损失，不过，整体影响不大。