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玛卡中有一种化合物叫做硫代葡萄糖，其能够与我们平常摄入人体的碘产生反应，过多食用玛卡，导致体内碘元素减少，会刺激到甲状腺引起甲状腺的肿大。
导致激素分泌过多
玛卡中含有的甾醇、皂苷是激素的前身，这些成分会激发体内激素合成。食用过量会导致激素分泌过多，造成欲望过度及损伤肾器官。
导致上火
玛卡是偏热性食物，而且是高滋补食品，过量的食用玛卡是容易上火的，本身有上火症状的人群，吃玛卡会加重病情。
导致过敏
玛卡对于一部分人来说是一种过敏原物质，吃玛卡后可能会出现过敏反应，特别是一次性食用过多，更是容易出现身体瘙痒难耐等过敏症状。
长痘痘
玛卡对人体荷尔蒙有双向调节作用，如果本身荷尔蒙分泌旺盛的人大量食用玛卡，是可能出现脸上长痘痘的现象的。
精力过于充沛
玛卡通过调节人体中枢神经系统的作用，适量食用能调节脑神经、脊神经和植物神经，而且玛卡中含有比较丰富的矿物质锌、蛋白质、维生素等营养成分，能给人体提供能量，补充体力，使人头脑清醒。但是如果大量食用，可能会导致过度兴奋和不眠，出现精力过于充沛，没有睡意的情况。