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鸭蛋的蛋黄中胆固醇的含量极高，而咸鸭蛋中的流油蛋黄甚是美味，吃太多容易导致胆固醇摄入超标，引起血液中胆固醇含量增高，增加心血管系统疾病的发生风险。
易消化不良
鸭蛋中的蛋白质比鸡蛋中的蛋白质要粗很多，不好消化，而咸鸭蛋在制作过程中由于食盐浓度过高，其中的蛋白质也更加凝集，在食用之后不是很好消化，吃太多容易引起腹胀、腹泻等消化不良等症状表现。所以，胃肠功能不佳的人更加不适合食用鸭蛋了。
易致血压增高
咸鸭蛋中食盐的含量极高，从吃的时候就能发现，有的咸鸭蛋就算是用清粥搭配着吃也感觉到咸，食用过多很容易导致体内钠离子浓度过高，容易引起血压增高。因此，高血压患者不适合食用，以免增高血压。
可能致癌
咸鸭蛋属于腌制品，在腌制过程中产生了很多的亚硝酸盐，这种成分具有致癌性，食用过多可能致癌。