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一般三文鱼中的寄生虫分为线虫和卵虫，它们存在于肛门、腹部及尾部。通过高温可以很好的消灭寄生虫，一般温度在70℃就能完全杀死寄生虫。
通过冷冻能够杀死寄生虫
高温或冷冻是杀死异寄生虫的有效方法。为了保持鱼肉的食用价值，目前仍然以冷冻法为主。
一些国家的环保和卫生部门出台了针对性的食品安全法规，如美国食品药品监督管理局规定鱼肉必须在零下35℃冷冻15个小时，或零下20℃冷冻7天后才能食用；欧盟的标准则是在零下20℃冷冻超过24小时。
香港食物安全中心规定，在选购原材料时，将鱼类冷藏于零下20℃24小时，一般能杀死鱼类中的寄生虫。
我国的三文鱼大多进口时，会经过严格的检验，大多是没有寄生虫的，可以适量的生吃。
如果三文鱼中的寄生虫没有被杀死而去食用的话，寄生虫会以幼虫的形式进入人体，对于肠胃以及消化系统有很大的损伤，容易引起消化器官障碍等症状。
高温烹食
有些带有寄生虫的三文鱼，建议用高温蒸煮，这样可以杀死寄生虫，同时配上其他作料，口感也是不错。
注意日期
三文鱼打捞上来后会进行冷藏，有规定解冻后三天就要销毁，朋友们吃三文鱼时应多注意下日期。