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生（青）木瓜的籽未成熟是白色的，成熟木瓜的籽是黑褐色的，黑褐色的木瓜籽更为常见。木瓜籽的功效和作用也是不容忽视的，木瓜籽性味酸、苦、温，中医认为其有祛湿疏筋、安神的功效，主治霍乱烦躁气急。古代名家论述中有记载木瓜籽的作用以及服用方法“治霍乱烦躁气急，每嚼七粒，温水咽之。”木瓜籽的采收时间在9~10月份间，可将成熟的果实剖开后取出里面的种子，然后将其鲜用或者是晒干都可。
在腌制牛肉之前，可以将木瓜里的籽取出，然后将牛肉放平，腌入酱汁里，然后上面铺一层木瓜籽，这样就把牛肉、酱汁、木瓜籽一起腌到入味，木瓜籽里天然的木瓜酵素就会发挥让牛肉软化的作用。待牛肉腌制好之后，将其取出，然后轻轻拨掉上面的木瓜籽即可。切记，牛肉在腌制之前要清洗干净，用木瓜籽腌制之后无需再次清洗。
木瓜籽也可以炒着吃，富含锌或者将木瓜子进行深化提取，做美容养颜护肤品，木瓜芦荟酒材料：芦荟鲜叶1千克、木瓜籽数粒、米酒1.8千克、砂糖50克做法：选用芦荟鲜叶洗净，切细。将木瓜籽切破，将其放入容器，加入砂糖和酒，瓶口密封保存1个月，将果实取出，再放2周-3周。如果多放点木瓜籽，对低血压症特别有效。这种酒特别有利于低血压者饮用。