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1、冷冻贮存
贮存前干燥的花粉用双层塑料袋装好，并封严袋口，防止吸水。若短期贮存，贮存温度保持0-5℃；长期贮存温度保持在-20℃～-18℃。可最大限度地减少花粉中的蛋白质和维生素的损失，避免霉烂生虫。
2、白砂糖贮存
准备自己食用的少量花粉，在短期内为防止花粉变质，可把花粉与白砂糖混合，然后装入瓶内压实，并在上层加3～5厘米白砂糖，封严瓶口，放暗处保存。
3、与蜂蜜混合贮存
少量的花粉也可与蜂蜜混合贮存，即在高浓度蜂蜜中加入需同存的花粉，可达到保存的目的。
天然的花粉有时会含有一些有害微生物，因此贮存之前必须进行灭菌，方法有：
一、酒精灭菌：用75%～85%的酒精浸泡或向花粉喷洒。
二、蜂胶酒精灭菌：在75%～85%的酒精中加一些蜂胶，形成约0.01%蜂胶溶液用来浸泡或向花粉喷洒，此法比酒精灭菌效果更好。
三、冰冻灭菌：把花粉置于-18℃以下环境中冷冻2～3天。
须强调的：花粉不得采取高温灭菌法，否则会破坏花粉的营养成分。