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益生菌酸奶：
在前者发酵的基础上，又添加了另外两种乳酸菌类（嗜酸乳杆菌和双歧杆菌）的益生菌酸奶，其在标识上通常有“益生菌”字样。
普通酸奶：
是由鲜牛奶添加两种菌类（嗜热链球菌和保加利亚乳杆菌）后，发酵制成的传统酸奶。
发酵过程不同
益生菌酸奶：
益生菌酸奶必须含有活性乳酸菌，这种酸奶除了具有乳酸菌发酵过程中产生的一系列有益人体的代谢产物外，其含有的活性乳酸菌，还有利于调节人体肠道微生态的平衡。
普通酸奶：
传统酸奶是不含有活性乳酸菌，但是非活性乳酸菌的酸奶也是有营养价值的，因为在乳酸菌发酵过程中，消耗掉了乳糖，产生一系列的代谢产物如维生素类、酶类等，这些代谢产物对人体都是有益处的。
营养价值不同
益生菌酸奶：
益生菌酸奶含有能在人体肠道内存活的乳酸菌，这种酸奶除了具有乳酸菌发酵过程中产生的一系列有益人体的代谢产物外，还可增加人体内肠道菌群益生菌的数量，利于调节人体肠道的微生态平衡。 益生菌酸奶中常用的益生菌有双歧杆菌，嗜酸乳杆菌、干酪乳杆菌等。如果商标标识上含有这类名称，才是真正意义上的益生菌酸奶。同时一些高品质的益生菌酸奶，厂家会在商标上注明产品中所含活的益生菌数量。一般来讲，要想获得益生菌的功效，则每天应该摄入10～10个活的益生菌，即一亿到十亿个活的益生菌。这一水平是最低疗效量。因此，选择益生茵含量高的产品会有更好的效果。
普通酸奶：
酸奶的发酵过程使奶中糖类、蛋白质有20%左右分别被水解成为小的分子（如半乳糖和乳酸、小的肽链和氨基酸等），奶中脂肪含量一般是3%～5%。经发酵后，乳中的脂肪酸可比原料奶增加2倍，这些变化使酸奶更易消化和吸收，各种营养素的利用率得以提高。酸奶由纯牛奶发酵而成，除保留了鲜牛奶的全部营养成分外，在发酵过程中乳酸菌还可以产生人体营养所必须的多种维生素，如VB1、VB2、VB6、VB12等。